该校始建于明朝正德年间，迄今已有五百年的历史。十一届三中全以来，运中这块古老的学府圣地，又焕发出了新的生机。81年被确定为山西省首批重点中学，先后被收入《中国名校》、《中国教育大词典》和《中国著名中学》等书，两次被评为山西劳模集体。高考成绩连年上升，95年达线327人，96年达线488人，97年达线528人，98年骤然增至626人，连续四年雄居全省之冠，英语实验班的高考达线率高达98%，考入清华、北大、复旦、南开等名牌大学的学生人数也在全省名列前茅、被誉为“大学生的摇篮”，在古老的河东大地掀起了一股汹涌澎湃的“运中潮”。

运城，古称河东，襟盐湖而带黄河，通三晋而达豫陕。河东故地，是华夏古老文化的发祥地之一，是名副其实的人文之乡。

运城中学的前身为创建于明朝正德9年的河东书院，几百年间几经搬迁，时断时续。新中国成立后，在党和人民的关怀和支持下，运城中学再次恢复建校，郭沫若先生亲笔为运城中学题写了校名。